El 6 de Noviembre de 1995 aparece en todo el mundo el último álbum, 'Made In Heaven'. El disco número 20 de su carrera. Iniciado en abril del 91´ y terminado por el resto de los integrantes con grabaciones que Freddie había hecho antes de morir. Fue producido a partir de las últimas sesiones de grabación de Freddie en 1991, agregando material desechado de sus álbumes de estudio anteriores.
Además, se incluyó material re-grabado obtenido del primer álbum solista de Freddie, Mr. Bad Guy, y una canción originalmente publicada en el primer álbum de The Cross, la banda paralela de Roger Taylor.
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Brian y Roger estaban involucrados en proyectos relacionados con la recaudación de fondos para la ayuda contra el sida. La última participación de John Deacon con la banda fue en 1997, cuando grabaron la canción 'No-One but You (Only the Good Die Young)'. Fue la última canción grabada por Queen, y fue publicada como bonus track en el álbum recopilatorio Queen Rocks a finales de ese año.
Debido a la demanda por parte de los fans, la canción posteriormente fue publicada como un sencillo alcanzando el puesto #13 en las listas británicas.
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En 1999 publican el cuarto disco recopilatorio de la banda, Greatest Hits III. El álbum está compuesto por 17 temas, que recorren la carrera de Queen desde Hot Space hasta Rocks, con algunos remixes y temas en solitario de Freddie Mercury y Brian May, además de colaboraciones con George Michael, David Bowie, Elton John, Wyclef Jean y Monserrat Caballé.
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